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学歴・職歴(2019年4月現在)

2001年3月 筑波大学附属駒場高等学校 卒業
2005年3月 東京大学 理学部 生物化学科 卒業/東京大学 理学部 生物情報科学学部教育特別プログラム 修了
2007年3月 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 修士課程 修了
2009年3月 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 博士後期課程 修了、博士(科学)

2009年4月 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 助教
2011年7月 東京大学 大気海洋研究所 講師
2011年7月 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻(兼担)
2014年4月 東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 准教授
2014年4月 東京大学 理学部 生物情報科学科(兼担)
2014年4月 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻(兼担、※1)
2014年4月 東京大学 大気海洋研究所 (兼務)
2018年4月 東京大学 定量生命科学研究所(兼務、※2)
2018年4月 東京大学 微生物科学イノベーション連携研究機構(兼務、※2)

※1 2015年4月に情報生命科学専攻より改組
※2 2018年4月より兼務

プロフィール

東京大学理学部生物化学科にて翻訳系タンパク質に関する分子生物学研究を行う。その後情報生命科学専攻に進学し、バイオインフォマティクスを専門分野とする。博士号取得後、助教として教育研究を行った後、同大学大気海洋研究所に所属し、生態学や進化学に関わる研究を行う。現在は同大学大学院理学系研究科生物科学専攻(理学部生物情報科学科)にて、生物情報科学とその周辺の融合領域における幅広い研究・教育を行っている。

受賞

2007年 東京大学大学院新領域創成科学研究科研究科長賞

2009年 東京大学大学院新領域創成科学研究科研究科長賞(2nd Taiwan–Japan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology組織委員長として)

2018年 日本進化学会研究奨励賞

2018年 日本バイオインフォマティクス学会 Oxford Journals–Japanese Society for Bioinformatics Prize

2019年 科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞

学外兼務・学会・研究会・学術雑誌

 日本バイオインフォマティクス学会

JSBi Website
理事長(会長)

  • 2019年4月–2021年3月

副理事長(副会長)

  • 2017年4月–2018年3月
  • 2018年4月–2019年3月

理事(評議員)

  • 2011年4月–2013年3月
  • 2013年4月–2015年3月
  • 2016年4月–2018年3月
  • 2018年4月–2020年3月

幹事

  • 2014年4月–2015年3月(ニュースレター幹事)
  • 2015年4月–2016年3月(会長補佐幹事、ニュースレター幹事、若手幹事)
  • 2016年4月–2017年3月(会長補佐幹事、ニュースレター幹事、若手幹事)
  • 2017年4月–2018年3月(ニュースレター幹事、若手幹事)
  • 2018年4月–2019年3月(事務局移設幹事、ISCB幹事)
  • 2019年4月–2020年3月(ISCB幹事)

 International Society for Computational Biology

ISCB Website
Board of Directors

  • 2018年1月–2021年12月

Committee Member of Evolution & Comparative Genomics COSI (Community of Special Interest)

  • 2017年11月–現在

 日本微生物生態学会

JSME Website
評議員

  • 2015年1月–2016年12月
  • 2017年1月–2018年12月

男女共同参画・ダイバーシティ推進委員

  • 2013年12月–現在

男女共同参画・ダイバーシティ推進WG委員

  • 2013年3月–2013年11月

 日本分子生物学会

MBSJ Website
キャリアパス委員

  • 2013年1月–2014年12月
  • 2015年1月–2016年12月

 環境DNA学会

eDNA Society Website
理事

  • 2018年4月–2018年9月
  • 2018年10月–2020年9月

 日本進化学会

SESJ Website
代議員

  • 2018年7月–2020年6月

 日本ゲノム微生物学会

SGMJ Website

 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター

KUICR Website
客員准教授

  • 2015年4月–2016年3月

 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター

DBCLS Website
業務協力者

  • 2010年4月–2018年3月

 日本学術会議

SCJ Website
特任連携会員

  • 2016年1月–2017年9月(第23期、若手アカデミー/若手科学者ネットワーク分科会(幹事))

連携会員

  • 2017年10月–2023年9月(第24期、バイオインフォマティクス分科会/進化学分科会(幹事)/若手アカデミー(幹事)/同若手科学者ネットワーク分科会(副委員長)/科学者委員会学術体制分科会/広報委員会/同HP分科会)

 Global Young Academy

GYA Website
Member

  • 2017年5月–現在

 NGS現場の会

NGS–Field Website
大会長(代表)

  • 2014年2月–2016年5月

ボードメンバー(世話人)

  • 2010年10月–現在

 生命情報科学若手の会

Bioinfowakate Website
代表

  • 2009年2月–2011年3月

理事(スタッフ)

  • 2009年2月–2015年3月

 Scientific Reports

Scientific Reports Website
Editorial Board Member

  • 2017年2月–現在

 Microbes and Environments

Microbes and Environments Website
Associate Editor

  • 2017年6月–現在

組織委員・プログラム委員

Program Committee, Joint 30th International Conference on Genome Informatics and Australian Bioinformatics And Computational Biology Society Annual Conference (GIW/ABACBS2019) (2019年12月/University of Sydney, Sydney, Australia)

ポスター編成委員第42回日本分子生物学会年会 (2019年12月/福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡県福岡市)

Organizer, Quest for Orthologs 6 (2019年7–8月/National Institute for Basic Biology, Okazaki, Japan)

Proceeding Committee, The 27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2019) (2019年7月/Congress Center Basel, Basel, Switzerland)

大会実行委員日本進化学会第20回大会(2018年8月/東京大学駒場キャンパス、東京都目黒区)

Proceeding Committee, The 26th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2018) (2018年7月/Hyatt Regency Hotel, Chicago, USA)

Abstract Co–chair, COSI on Evolution & Comparative Genomics, The 26th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2018) (2018年7月/Hyatt Regency Hotel, Chicago, USA)

アドバイザーGenome Biz 2018(2018年6月/株式会社ディー・エヌ・エー、東京都渋谷区)

Program Committee, The 16th Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC2018) (2018年1月/ Hiyoshi Campus of Keio University, Yokohama, Japan)

Program Committee, The 28th International Conference on Genome Informatics (GIW2018) (2017年10–11月/Hotel Samjung, Seoul, Korea)

準備委員環境微生物系学会合同大会2017(2017年8月/東北大学川内キャンパス、宮城県仙台市)

アドバイザーGenome Biz Meetup 2017(2017年6月/TECH PLAY SHIBUYA、東京都渋谷区)

主催第2回若手科学者サミット(2017年6月/日本学術会議、東京都港区)

大会長アドバイザーNGS現場の会第五回研究会(2017年5月/仙台国際センター、宮城県仙台市)

組織委員第10回日本ゲノム微生物学会年会(2016年3月/東京工業大学大岡山キャンパス、東京都目黒区)

プログラム委員日本バイオインフォマティクス学会2015年年会・第4回生命医薬情報学連合大会(2015年10月/京都大学宇治キャンパス、京都府宇治市)

大会長NGS現場の会第四回研究会(2015年7月/つくば国際会議場、茨城県つくば市)

Program CommitteeThe 25th International Conference on Genome Informatics (GIW2014) (2014年12月/Tokyo International Exchange Center, Tokyo, Japan)

組織委員(IT担当)・ポスター編成委員第37回日本分子生物学会年会(2014年11月/パシフィコ横浜、神奈川県横浜市)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第5回研究会(2014年2月/東京大学検見川セミナーハウス、千葉県千葉市)

組織委員日本バイオインフォマティクス学会2013年年会・第2回生命医薬情報学連合大会(2013年10月/タワーホール船堀、東京都江戸川区)

世話人NGS現場の会第三回研究会(2013年9月/神戸国際会議場、兵庫県神戸市)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第4回研究会(2013年3月/基礎生物学研究所、愛知県岡崎市)

組織委員日本バイオインフォマティクス学会2012年年会・第1回生命医薬情報学連合大会(2012年10月/タワーホール船堀、東京都江戸川区)

プログラム委員日本バイオインフォマティクス学会2012年年会・第1回生命医薬情報学連合大会(2012年10月/タワーホール船堀、東京都江戸川区)

Program Committee, Recommender System Challenge (RecSysChallenge 2012), ACM Recommender Systems 2012(2012年9月/Burlington Hotel, Dublin, Ireland)

世話人NGS現場の会第二回研究会(2012年5月/ホテル阪急エキスポパーク、大阪府吹田市)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第3回研究会(2011年10月/基礎生物学研究所、愛知県岡崎市)

オーガナイザー生命情報科学若手の会沖縄セミナー(2011年9月/独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構、沖縄県恩納村)

世話人NGS現場の会第一回研究会(2011年5月/熱海ニューフジヤホテル、静岡県熱海市)

Advisory Committee, The 4th Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (4th AYRCOB)(2010年12月/Biopolis, Singapore, Singapore)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第2回研究会(2010年10月/国立遺伝学研究所、静岡県三島市)

Organizing Committee, The 3rd Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (3rd AYRCOB)(2010年3月/National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan)

オーガナイザー生命情報科学若手の会よりよい共同研究研究会(2009年12月/パシフィコ横浜、神奈川県横浜市)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第1回セミナー(2009年6月/東京大学医科学研究所、東京都港区)

オーガナイザー生命情報科学若手の会第1回研究会(2009年4月/国立遺伝学研究所、静岡県三島市)

Conference Chair, The 2nd Taiwan-Japan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology(2008年11月/AIST Tokyo Waterfront, Tokyo, Japan)

Organizing Committee, The 1st Japan-Taiwan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology(2008年3月/National Tsing Hua University, Hsinchu, Taiwan)

  • アジア若手計算オーミクス国際会議についてはこちらでご紹介しています。

セッションオーガナイザー

オーガナイザー、DNAビッグデータで解き明かす未知の生物多様性、第42回日本分子生物学会年会(2019年12月/福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡県福岡市)

オーガナイザー次世代ビッグデータ研究の潮流第92回日本生化学会大会(2019年9月/パシフィコ横浜、神奈川県横浜市)

企画者環境DNA研究のフロンティア:生態学と分子生物学からのアプローチ第66回日本生態学会大会(2019年3月/神戸国際会議場・神戸国際展示場、兵庫県神戸市)

オーガナイザー進化・群集生態学の新手法で切り拓く微生物研究のフロンティア日本微生物生態学会第32回大会(2018年7月/沖縄コンベンションセンター、沖縄県宜野湾市)

Abstract Chair, COSI on Evolution and Comparative Genomics, The 26th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2018) (2018年7月/Hyatt Regency Hotel, Chicago, USA)

オーガナイザーNGS現場の会セッション「NGSデータをひもとく新しいアプローチ」日本バイオインフォマティクス学会2017年年会・第6回生命医薬情報学連合大会(2017年9月/北海道大学札幌キャンパス、北海道札幌市)

企画・座長データベース・カルチャーコレクションの活用が切り開く「複眼的」環境微生物研究環境微生物系合同大会2017(2017年8月/東北大学川内北キャンパス、宮城県仙台市)

企画・座長ゲノムシークエンス技術・方法論の発展はどのように環境系微生物学分野の未来を変えていくのか?環境微生物系合同大会2017(2017年8月/東北大学川内北キャンパス、宮城県仙台市)

オーガナイザーバイオイメージインフォマティクス:大規模生命画像データの情報解析に基づく生物学日本バイオインフォマティクス学会2016年年会・第5回生命医薬情報学連合大会(2016年9–10月/東京国際交流館プラザ平成、東京都江東区)

オーガナイザー細菌群集構造解析のためのバイオインフォマティクス実践演習日本微生物生態学会30回大会(2015年10月/土浦亀条ホテル、茨城県土浦市)

オーガナイザーシステムワイド計測とバイオインフォマティクス第37回日本分子生物学会年会(2014年11月/パシフィコ横浜、神奈川県横浜市)

司会博士の多様なキャリアパスを切り開く第37回日本分子生物学会年会(2014年11月/パシフィコ横浜、神奈川県横浜市)

オーガナイザーNGS現場の会・オープンバイオ研究会・生命情報科学若手の会・定量生物学の会合同シンポジウム「これからの生命科学を考える」日本バイオインフォマティクス学会2012年年会・第1回生命医薬情報学連合大会(2012年10月/タワーホール船堀、東京都江戸川区)

コンビーナバイオインフォマティクス最新事情:未曾有のデータを新知見に繋げるために第28回日本微生物生態学会大会(2012年9月/豊橋技術科学大学、愛知県豊橋市)

その他の委員等

科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター ライフサイエンスデータベース統合推進事業(統合化推進プログラム) 研究アドバイザー

  • 2017年4月–現在

文部科学省 科学技術政策研究所 科学技術動向研究センター 専門調査員

  • 2014年4月–現在

科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター運営委員会 人材育成分科会委員

  • 2012年12月–2014年3月
  • 2015年1月–2015年3月
  • 2015年4月–2016年3月

科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター運営委員会 人材育成分科会ワーキンググループ委員

  • 2013年10月–2014年3月

バイオインフォマティクス技術者認定試験 試験問題作成協力者

  • 2014年

Mendeley Advisor

  • 2012年12月–現在

学内委員

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻・理学部生物情報科学科

  • 広報・ホームページ委員:2014、2015、2016、2017、2018、2019年度
  • ネットワーク委員:2014、2015、2016、2017、2018、2019年度
  • 就職担当委員:2016、2017、2018年度
  • キャリア支援室運営委員:2016、2017、2018年度
  • 教育会議委員:2017、2018年度
  • 推薦入試入学者アドバイザー:2016、2017、2018年度
  • オープンキャンパス実行委員:2014年度

東京大学大気海洋研究所

  • 広報委員:2011、2012、2013年度

報告書等

G7 science academies
Joint statements 2019 to their respective governments、2019年3月
Académie des sciences report
Statements

第18期日本分子生物学会キャリアパス委員会大規模アンケート解析ワーキンググループ
第3回日本分子生物学会男女共同参画実態調査報告書、2014年11月
PDF

日本学術会議 基礎生物学委員会・統合生物学委員会・農学委員会・ 基礎医学委員会・薬学委員会・情報学委員会合同 バイオインフォマティクス分科会
大容量情報時代の次世代生物学(日本学術会議 報告)、2014年9月

PDF

科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター運営委員会人材育成分科会
バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエンサ)、2014年3月
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